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生信分析牵涉到实验设计，重测序主要是基因跟性状关联分析。性状选择：单位性状、相对性状；显性性状、隐性性状；数量性状、质量性状；形态特征、生产性能、产子率等等。从做研究的角度来讲，性状越多越好，从发文章的角度来讲，一次基因组重测序，可以进行多次性状关联分析，得到多篇文章，提高论文产量，降本增效，关键是要大量采集性状数据。大多数人的分析方向都集中在：GWAS、群体结构，其实还有一个方向：基因组选择，三个方向进行分析，增加文章分量。所以在进行生信分析的时候一般会考虑以下问题：采集了多少性状，原则上越多越好，越全面越好，表型数据是否全面？这些性状如何分类，是一起分析还是分开分析？是否需要进行基因组评估，GWAS，基因型填充？是否考虑基因和环境的互作效应？需要考虑哪些固定效应？是否要进行群体分析？这样搞下来，测序费用节省了不少，文章数量可以增加，文章分量可以提升，重测序时间大概20天，分析到初稿大概60天，三个月就可以搞出一篇高分论文。有需求，找Nothing（Thangyou_baby）。
